本分局置分局長一名綜理本分局勤、業務、副分局長二名襄助分局長處理本分局勤、業務,另置一、二、三、四、五組、勤務指揮中心、偵查隊、警備隊;並下設斗南派出所、新光派出所、新崙派出所、四維派出所、建國派出所、大埤分駐所、怡美派出所、古坑分駐所、永光派出所、東和派出所、華山派出所、樟湖派出所(與華山派出所合署辦公)、草嶺派出所、交通小隊。